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  • NGSデータ解析サービス

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製品概要

次世代シーケンサーデータ解析の経験豊富なGenomatix社の研究者による次世代シーケンサーデータ解析サービスです。Genomatix社独自技術を利用した高精度な解析結果を提供します。

対応シーケンサー

  • illumina社次世代シーケンサー
  • ライフテクノロジーズ社次世代シーケンサー
  • ロシュ・ダイアグノスティックス社次世代シーケンサー
  • Helicos社次世代シーケンサー

Genomatix社システムは illumina社 Illumina iConnect Partner 、ライフテクノロジー社の認定ソフトウェアです。

解析アプリケーション

解析サービスは基本解析、オプション解析の2種類ございます。
解析アプリケーションはトランスクリプトーム、ChIP-Seq、Genotypeの3種類です。それ以外の解析を希望される場合はご連絡ください。
解析結果はお客様の要望によって異なりますが、主にテキストファイル、画像ファイルでお渡ししています。

解析アプリケーション トランスクリプトーム ChIP-Seq Genotype
基本解析
  • ゲノムへマッピング
  • ゲノムへマッピング
  • ゲノムへマッピング
オプション解析
  • splice junction
    ライブラリへマッピング
  • クラスタリング
  • トランスクリトの発現定量
  • 新規スプライシングバリアント・トランスクリプトユニットの検出
  • 遺伝子ネットワーク解析
  • GO解析
  • クラスタリング
    (Peak finding)
  • 転写制御因子解析
  • プロモーター解析
  • 生物種間比較
    ゲノム解析
  • 新規転写因子
    モチーフ検索
  • Correlation
    解析
  • SNPの検出
  • 関連SNPsの検出
    (アミノ酸置換など)
  • 欠失・挿入部位の検出
  • Copy number variation

基本解析

Genomatix社が独自に開発したゲノムマッピングアルゴリズム(Genomatix Mining Station)を利用した解析結果を提供します。
既存アルゴリズムより、最大20%高精度な結果を提供します。

図:基本解析の流れ
図:基本解析の流れ

トランスクリプトームオプション解析

Replicateデータ、2sample比較解析も可能です。ペアエンドデータからfugion geneの探索オプションが利用できます。

図:トランスクリプトーム オプション解析の流れ
図:トランスクリプトーム オプション解析の流れ

ChIP-Seq オプション解析

Replicateデータ、2sample比較解析も可能です。ペアエンドデータからfugion geneの探索オプションが利用できます。

図:ChIP-Seq オプション解析の流れ
図:ChIP-Seq オプション解析の流れ

Genotype オプション解析

図:Genotype オプション解析の流れ
図:Genotype オプション解析の流れ

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